Innhold
- DNA, gener og alleler
- Alleler og fenotyper
- Definisjon av allelfrekvens
- Beregn allelfrekvens
- Eksempelberegninger
- Genotypiske frekvenseksempel
- Eksempel på allelfrekvens
- Tolkning av genotypiske og allelfrekvenser
Deoksyribonukleinsyre, mer populært kjent som DNA, er et molekyl som finnes i det store flertallet av levende organismer og virus som finnes på jorden. DNA bærer genetisk informasjon, eller koden, som gjør alt til hva det er.
DNA skiller seg mellom arter og mellom individer i en art. Hos mennesker bestemmer for eksempel DNA fargen på menneskets øyne, hud, hår, høyde og alle andre attributter som gjør hver person unik.
DNA, gener og alleler
DNA består av forskjellige gener. Gener bærer den genetiske informasjonen fra hver av foreldrene.
Hvert gen finnes på et spesifikt lokus på et kromosom. Et gen kan ha flere varianter består av forskjellige allelsekvenser.
Alleler og fenotyper
Alleler bestemmer synlige individuelle egenskaper, kalt fenotyper. Blå, grønn, brun og hassel er for eksempel alle forskjellige fenotyper for det menneskelige øyet.
Når man ser på et av de mange genene for øyenfarge i en gruppe mennesker, ville de med blå øyne ha en annen sekvens av alleler enn de med brune, hassel og grønne øyne.
Definisjon av allelfrekvens
Allelfrekvensen er antall individer i en populasjon som har en spesifikk alleltype. Folk bruker allelfrekvensberegningen for å forstå hastigheten en fenotype forekommer i en populasjon.
Denne informasjonen gir forståelse for det genetiske mangfoldet i en populasjon. Når allelfrekvenser registreres over tid, kan endringer i genetisk mangfold observeres.
Beregn allelfrekvens
For å beregne allelfrekvens må det totale antall individer i befolkningen telles. Deretter kan du telle antall individer som hver har den spesifikke fenotypen det gjelder.
Lag en sum av alle totalsummene. For å finne allelfrekvensene deles antall ganger en allel telles i en populasjon av det totale antall allelkopier som finnes i det genet.
Eksempelberegninger
Si for eksempel at det er 100 individer i en populasjon og to typer alleler, B for blå øyne og G for grønne øyne. Hver person har to eksemplarer av hvert allel, så multipliser to med 100 for å gi 200 allelkopier i befolkningen.
I det virkelige liv er det mange gener som koder for menneskelig øyenfarge, men for dette scenariet er det bare tre forskjellige allelkombinasjoner i denne genpuljen; BB, BG og GG. Neste tell antall personer i befolkningen med hver alleltype.
Genotypiske frekvenseksempel
I dette eksemplet er det 50 personer med BB, 23 personer med BG og 27 personer med GG. For å finne de genotypiske frekvensene deler du ganske enkelt antall personer med en spesifikk fenotype med det totale antallet mennesker.
I dette tilfellet betyr 50 BB delt på 100 mennesker at 50 prosent av befolkningen har BB-genotypen. Genfrekvensen for BG ville være 23 prosent, og 27 prosent av menneskene i genpoolen ville ha GG-gentypen.
Eksempel på allelfrekvens
Mens genotype frekvenser ser på uttrykket av genene, ser allelfrekvensene på antall ganger en spesifikk allel forekommer i en populasjon. For å finne allelfrekvensen til B i dette eksemplet multipliserer du 50 med to, da det er to Bs i BB-genotypen.
Legg deretter til personer med BG-genotypen, da de også hver har en B-allel, og gir totalt 123 B-alleler. Del til slutt 123 med 200 som hver person i befolkningen har to alleler, hvilket gir en allelfrekvens på 0,615 eller 61,5 prosent.
Gjør deretter det samme for G-allelen. Ved å multiplisere de 27 personene med GG-alleler med to og legge til de 23 personene som også har en G-allel og deretter dele dette tallet, 77, med 200, resulterer det i 0,385 eller 38,5 prosent.
Kontroller for feil ved å forsikre deg om at alle allelfrekvensene legger opp til 1 eller 100 prosent. Her er 61,5 lagt til 38,5 tilsvarer 100.
Tolkning av genotypiske og allelfrekvenser
Disse beregningene har gitt informasjonen om hvor mange som har blå fenotype øyne, og hvor mange som har grønne fenotype øyne i denne populasjonen på 100 personer. Fra allelfrekvensene er det tydelig at B-allelet er mer dominerende i en populasjon.
Ved å fortsette denne studien i kommende generasjoner, vil det fremgå om det er endringer i allelfrekvensene over tid og gir en viss innsikt i utviklingen av befolkningen.