Innhold
- Generell DNA-ekstraksjon
- Plante- og dyreceller
- Plante-DNA-ekstraksjon
- DNA-ekstraksjon av dyr
- DNA-forskjellene
Strukturen til dobbeltstrenget DNA er universell i alle levende celler, men forskjeller forekommer i metodene for å trekke ut genomisk DNA fra dyre- og planteceller. Selv om genomisk DNA lever i kjernen av celler, avhenger mengden og renheten av ekstrahert DNA av typen og størrelsen på cellen. For eksempel inneholder visse celler mer DNA og urenheter enn andre. Les videre for å lære mer om DNA-ekstraksjonsforskjeller.
Generell DNA-ekstraksjon
Hvis du behandler plante- og dyreceller med et såpestoff, vil det forringe lipidene i cellen og kjernemembranene. Deretter vil DNA-blandingen skille seg fra cellemembranene og proteiner. Deretter kan du bruke alkohol for å utfelle DNA i løsningen. Avhengig av mengden i prøven, kan DNA være synlig med det blotte øye. Husk imidlertid at denne enkle prosedyren ikke nødvendigvis produserer DNA med høy renhet.
Plante- og dyreceller
Plantecellene skiller seg fra dyreceller på grunn av deres stive cellevegg og organeller som kloroplasten. De inneholder også proteiner og enzymer som spiller en rolle i fotosyntesen. Noen planteceller har polyploidi, noe som betyr at de har mer enn en kopi av hvert kromosom per celle. I tillegg produserer cellulære prosesser som forekommer i planter som fotosyntese, en rekke sekundære metabolitter. Dyreceller har ikke en cellevegg, men trenger fortsatt kjemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) for å forstyrre cellemembranen for å frigjøre genomisk DNA.
Plante-DNA-ekstraksjon
Plante genomisk DNA er vanskeligere å trekke ut på grunn av plantens cellevegg. Du kan fjerne den ved homogenisering eller ved å tilsette cellulase for å nedbryte cellulosen som utgjør celleveggen. I tillegg kan metabolittene som er tilstede i plantecellen forstyrre genomisk DNA-ekstraksjon ved å forurense DNA-prøven under utfellingen.
DNA-ekstraksjon av dyr
Perifere blodleukocytter er hovedkilden til animalsk genomisk DNA, men prøveinnsamling er vanskelig fordi blodet må komme direkte fra dyret. Blod inneholder en rekke forbindelser som proteiner, lipider, hvite blodlegemer, røde blodlegemer, blodplater og plasma, som kan forurense DNA-prøven. Imidlertid er den primære forurensningen av animalsk DNA ekstrahert fra blodprøver heme, som er den ikke-proteinkomponenten i hemoglobin.
DNA-forskjellene
Forskjellene mellom plante- og dyre-DNA ligger i sekvensen av baser i helixen. Forbindelser som finnes i planteceller er fraværende i dyreceller, og DNA-basesekvenser gjenspeiler dette. Dessuten er det genomiske plantens DNA ofte større enn animalsk DNA. Disse forskjellene påvirker også ekstraksjonsmetoder, utbytte og renhet av DNA.