Hva er den mest logiske sekvensen av trinn for spleising av utenlandsk DNA?

Posted on
Forfatter: Lewis Jackson
Opprettelsesdato: 9 Kan 2021
Oppdater Dato: 14 Kan 2024
Anonim
Bioinformatics - Lecture 10 - Databases and biomaRt (Part 1)
Video: Bioinformatics - Lecture 10 - Databases and biomaRt (Part 1)

Det var ikke så lenge siden at genteknologi var ting av science fiction - noe som fikk en organisme til å vokse med kjennetegn ved en annen. Siden 1970-tallet har genetiske manipulasjonsteknikker avansert til det punktet hvor skjøting av fremmed DNA i en organisme nærmest er rutinemessig. For eksempel kan gener for skadedyrresistens skjøtes i mais, gener for å lage humant insulin kan settes i bakterier og gener for å etterligne humane kreftformer kan settes i laboratoriemus. Detaljene i prosedyren er for kompliserte til å beskrive i en kort artikkel, med mange alternativer på hvert trinn, men den konseptuelle konturen av den logiske trinnsekvensen er ganske grei.

    Inkuber plasmid-DNA og DNA av interesse med et restriksjonsenzym. Restriksjonsenzymet vil detektere en spesifikk sekvens av DNA-baser og kutte DNAet fra hverandre på det tidspunktet. Restriksjonsenzymer er avledet fra noen bakterias forsvarsmekanisme mot virus. De er molekyler som vil knipse DNA der de oppdager et gitt mønster av baser.

    Inkuber det utskårne plasmidet og de genomiske DNA-fragmentene med DNA-ligase. Med de fleste restriksjonsenzymer vil det sirkulære plasmidet og de genomiske DNA-fragmentene ha komplementære "klissete ender" som vil feste seg til hverandre. DNA-ligase vil deretter fullføre liming av bitene sammen. Resultatet er en haug med sirkulære plasmider som inkluderer deler av genomisk DNA.

    Sett plasmidene i bakterier og dyrk bakteriene for å vokse kolonier av organismer impregnert med modifisert DNA. Hvis plasmidet ditt har et antibiotikaresistent gen som vertsbakteriene mangler, kan du automatisk screene for vellykket modifiserte bakterier ved å dyrke bakteriene på et antibiotisk tilført vekstmedium. Det er flere metoder for å sette plasmidene inn i bakteriene, for eksempel å bruke en mikronål, bruke et elektrisk felt for å åpne opp små hull i bakteriemembranen, eller bare sette bakteriene og plasmidene sammen i den samme løsningen og la bakteriene absorbere dem naturlig.

    Prøve celler fra de forskjellige koloniene av modifiserte bakterier. Vask de utvalgte cellene med en vaskemiddeloppløsning for å bryte ned bakteriemembranene og trekke ut DNA, deretter varme det eller eksponere det for natriumhydroksyd for å skille strengene. Dette utsetter basesekvensen til DNA for analyse.

    Inkuber DNA med en lysstoffrør. Lys et ultrafiolett lys på det inkuberte DNA og se etter fluorescens. Sonden består av en kort sekvens med DNA som samsvarer med det genomiske DNAet du har satt inn. Der sonden samsvarer med DNA-en du leter etter, vil den lyse når den blir opplyst.

    Isoler bakteriene fra koloniene som inneholder genet du ønsker å sette inn. Dupliser DNAet ditt ved å enten la bakteriekoloniene vokse, eller trekke ut DNAet slik du gjorde før, og dupliser det i en polymerasekjedereaksjonsmaskin.