Innhold
- Genotypedefinisjon
- Å kjenne til genotypen: Punnett Square
- Polymerase kjedereaksjon
- Hybridiseringssonde
- Direkte DNA-sekvensering
Begrepet genotype refererer til den komplette genetiske sammensetningen av en organisme. Det brukes også til å beskrive de forskjellige variasjonene av et gen, kjent som alleler. Mennesker har to alleler for hver genetisk stilling, eller lokus.Sammenlagt anses hvert par alleler som en spesifikk genotype.
Å kjenne til genotypen eller et genotypeeksempel på et individ kan være viktig for å forstå genetisk uttrykk, diagnostisere sykdommer, lære om genetiske mutasjoner og mer.
Genotypedefinisjon
La oss starte med en spesifikk definisjon av genotype. En individs genotype er den arvelige genetiske informasjonen den personen har. Dette refererer til genene dine, DNA, alleler osv. I ett altomfattende ord. Et eksempel kan være å beskrive en blomsterfargenotype som RR (noe som betyr at de har to "røde" alleler, RR, for fargen) eller Rr (en "rød" allel, R og en "rosa" allel, r, for fargen) .
Fenotypen din er derimot det og individet fysisk viser at det er bestemt av genotypen de har. Mens to individer kan ha samme fenotype, kan de ha helt forskjellige genotyper. Etter blomstereksemplet fra tidligere, ser både RR- og Rr-blomstene ut til å være røde fordi rød er dominerende over rosa. Imidlertid er de forskjellige i sin genotype siden en er homozygot (RR) og en er heterozygot (Rr).
Les mer om definisjonen, alleler og eksempler på genotyper.
Å kjenne til genotypen: Punnett Square
En Punnett-firkant er en av de enkleste måtene å bestemme genotype. Torget er faktisk et minikart som brukes til å bestemme den potensielle genotypen for et avkom med hensyn til spesiell egenskap.
Hvis du vil lage en Punnett-firkant, skriver du alle mulige alleler over toppen av plassen for den ene overordnede og alle mulige alleler for den andre overordnede på venstre side. Hver listet allel blir enten en kolonne, for toppalleler, eller en rad, for venstre-alleler, inne i firkanten. Kvadratet fylles ut når du skriver ned alleler fra toppen i de respektive kolonnene og deretter skriver ned alleler fra siden i de respektive radene, og lager en firkant full av potensielle genotyper.
Et genotypeeksempel ved bruk av Punnett-torget er de klassiske erteeksperimentene utført av Gregor Mendel. Ta en titt på spesifikke genotypeeksempler og Punnett-firkanter her.
Polymerase kjedereaksjon
PCR ble utviklet i løpet av 1980-tallet og genererer et spesifikt DNA-standpunkt basert på en malstreng. I tillegg til en templatstreng, er DNA-polymerase, nukleotider og korte biter av enkeltstrenget DNA nødvendig for en PCR-reaksjon.
På et bestemt tidspunkt begynner PCR-reaksjonen å generere kopier eksponentielt, og bare i løpet av denne fasen er det mulig å bestemme den opprinnelige mengden av målsekvensen i prøven. Metoden brukes til sekvensering, kloning og genteknologiske formål.
Les mer om forskjellene mellom PCR-kloning.
Hybridiseringssonde
En hybridiseringsprobe brukes for å bestemme om en fysisk egenskap skyldes genotype. Prosessen begynner med fullstendig fordøyelse av DNA som skal analyseres etterfulgt av overføring til en filtermembran. Deretter blir sonden lagt til filteret og tillatt å binde seg til en målsekvens.
Etter omtrent 24 timer vaskes filteret for å fjerne enhver ikke-bundet sonde. Et hybridiseringsprob kan også brukes til å bestemme effektiviteten av en kloningsprosess eller finne ut antall kopier av et spesifikt gen.
Direkte DNA-sekvensering
Human Genome Project førte til utviklingen av en rekke kraftige DNA-sekvenseringsverktøy. I tillegg til å dekode det komplette genomet til Homo sapiens, har disse verktøyene tillatt forskere å sekvensere de komplette genomene til en rekke andre organismer, inkludert mus, rotter og ris. Topp moderne sekvenseringsverktøy gjør det mulig for dagens genetikere å sammenligne og manipulere store mengder DNA raskt og billig.
Dette vil gi mulighet for å bestemme genetikkens rolle i sykdomssårbarhet, organismenes genetiske respons på miljømessige stimuli og spore utviklingen av en egenskap eller art, ifølge National Human Genome Research Institute.