Innhold
Kromosomalt overfall, også kalt genetisk overkjøring, er en normal prosess der gener rekombineres. Rekombinasjonen øker genetisk variasjon ved rekombinering for å produsere forskjellige egenskaper.
TL; DR (for lang; ikke lest)
Gen-interferens er et mål på uavhengighet av crossovers fra hverandre. Hvis en crossover i en region påvirker en crossover i en annen region, kalles denne interaksjonen forstyrrelse. Interferens = 1 - c.o.c., hvor c.o.c. er tilfeldighetskoeffisienten (c.o.c.)
Mennesker har 23 kromosomer. Under meiose deler en celle seg to ganger for å danne fire datterceller. Disse fire dattercellene har halvparten av antall kromosomer i foreldrecellen. De kan deretter feste seg til en annen kromosom halvdel fra enten egget eller sæden for å bli et helt par.
Noen ganger blir ikke disse to delene sammen. Hvis brikkene går i stykker, kan de da bli sammen med et annet ødelagt stykke. De to genetiske kopiene som rekombinerer kalles kromatider. Problemer som Downs syndrom eller andre genetiske lidelser kan være forårsaket når gener kombinerer feil.
De fleste crossover forekommer normalt. Noen ganger oppstår en dobbel crossover. Dette er når kromatidene går sammen på to punkter i stedet for ett. På det andre kontaktpunktet kan kromatidene igjen skille seg og igjen utveksle genetisk informasjon.
Gen-interferens er et mål på uavhengighet av crossovers fra hverandre. Med andre ord, siden du vet at doble crossovers forekommer, må du svare på spørsmålet om crossovers i tilstøtende kromosomregioner er uavhengige eller ikke. Hvis de ikke er uavhengige, betyr det at en crossover i ett område påvirker sannsynligheten for at det blir en crossover i et tilstøtende område. Hvis en crossover i en region påvirker en crossover i en annen region, kalles denne interaksjonen forstyrrelse.
Hvordan beregne interferens
Når man vurderer hvordan man skal beregne interferens, er det første trinnet å beregne tilfeldighetskoeffisienten (c.o.c.). Den c.o.c. på sin side avhenger av sannsynligheten for en dobbel crossover, kalt crossover-frekvensverdi, også kjent som "frekvensen av doble rekombinanter."
Tilfeldighetskoeffisienten er forholdet mellom observerte og forventede doble rekombinanter.
Tilfeldighetskoeffisient = observerte frekvens dobbel rekombinanter / frekvens forventet dobbel rekombinant
Det forventede antall doble rekombinanter i en prøve av to uavhengige regioner er lik produktet av de rekombinante frekvensene i de tilstøtende regionene.
Interferens blir deretter definert som følger:
interferens = 1 - c.o.c.
Interferens forteller deg hvor sterkt en crossover i et av DNA-regionene forstyrrer dannelsen av en crossover i den andre regionen.
Hvis interferens er null, betyr dette at de doble overgangene skjer som forutsagt, og at en overkjøring i ett område oppstår uavhengig av en overkjøring i et tilstøtende område.
Hvis interferens er 1, betyr dette at interferens er fullstendig og at ingen doble overkjøringer blir observert fordi en krysning i ett område eliminerer sannsynligheten for en krysning i et tilstøtende område.
Vanligvis vil dataene dine vise en interferens mellom 0 og 1. Verdier som er høyere enn null, men under en indikerer at interferens forekommer.