Genotype og fenotypedefinisjon

Innhold

• TL; DR (for lang; ikke lest)
• Betydningen av genotype og fenotype
• Darwin m.fl. oppdagelser
• Konkurrerende teorier om arv
• Mendels Intuisjon om genotype
• Moderne fremskritt

Begrepene genotype og fenotype er så intrikat koblet at de kan være vanskelige å skille fra hverandre. Det komplekse forholdet mellom alle organismenes genotyper og fenotyper var et mysterium for forskere frem til de siste 150 årene. Den første forskningen som nøyaktig avslørte hvordan de to faktorene samhandler - med andre ord hvordan arvelighet fungerer - bidro til noen av de mest betydningsfulle gjennombruddene i biologiens historie, og banet vei for funn om evolusjon, DNA, arvelig sykdom, medisin, arter taksonomi, genteknologi og utallige andre grener av vitenskap. På det tidspunktet for den tidlige forskningen var det ennå ikke ord for genotype eller fenotype, selv om hvert funn førte forskere nærmere til å utvikle et universelt ordforråd for å beskrive prinsippene om arvelighet de konsekvent observerte.

TL; DR (for lang; ikke lest)

Ordet genotype refererer til den genetiske koden som finnes i nesten alle levende organismer, som en blå. Ordet fenotype refererer til de observerbare trekk som manifesterer seg fra organismenes genetiske kode, enten det er på et mikroskopisk, metabolsk nivå eller et synlig eller atferdsnivå.

Betydningen av genotype og fenotype

Ordet genotype refererer i sin vanligste bruk til den genetiske koden som finnes i nesten alle levende organismer, som er unik for hvert individ, med unntak av identiske avkom eller søsken. Noen ganger brukes genotype på en annen måte: I stedet kan den referere til en mindre del av en organisms genetiske kode. Vanligvis har denne bruken å gjøre med den delen som er relevant for en viss egenskap i organismen. Når vi for eksempel snakker om kromosomene som er ansvarlige for å bestemme kjønn hos mennesker, er genotypeforskerne referanse det tjueførste kromosomparet, i stedet for hele menneskets genom. Vanligvis arver hannene X- og Y-kromosomene, og hunnene arver to X-kromosomer.

Ordet fenotype refererer til de observerbare trekk som manifesterer seg fra organismens genetiske blå, enten det er på et mikroskopisk, metabolsk nivå eller et synlig eller atferdsnivå. Den refererer til organismens morfologi, enten den er synlig med det blotte øye (og andre fire sanser) eller krever spesialutstyr for å se. For eksempel kan fenotype referere til noe så lite som arrangementet og sammensetningen av fosfolipider i cellemembraner, eller den ornamenterte fjærdrakten i et individuelt mannlig indisk påfugltog. Selve ordene ble myntet av en dansk biolog ved navn Wilhelm Johannsen i 1909, sammen med ordet "gen", selv om han og mange andre menn ble feiret for et stort antall teoretiske fremskritt i de foregående tiår før ordene "genotype" og " fenotype "ble noen gang ytret.

Darwin m.fl. oppdagelser

Disse biologiske funnene skjedde i løpet av midten av 1800-tallet til begynnelsen av 1900-tallet, og på den tiden arbeidet de fleste forskere alene eller i små samarbeidsgrupper, med svært begrenset kunnskap om den vitenskapelige fremgangen som skjedde samtidig med sine jevnaldrende. Når begrepene genotype og fenotype ble kjent for vitenskapen, ga de troverdighet til teorier om hvorvidt det fantes en type partikkelformet materiale i organismer 'celler som ble overført til avkom (dette viste seg senere å være DNA). Verdens økende forståelse av genotype og fenotype kunne ikke deles ut fra den økende oppfatningen om arvelighetens og evolusjonens natur. Før denne tiden var det liten eller ingen kunnskap om hvordan arvelig materiale ble videreført fra en generasjon til fortiden, eller hvorfor noen egenskaper ble videreført og noen ikke.

Forskernes viktige funn om genotype og fenotype handlet alle på en eller annen måte om de spesielle reglene for hvilke egenskaper som ble gitt videre fra en generasjon av en organisme til den neste. Spesifikt var forskere nysgjerrige på hvorfor noen av organismens egenskaper ble overført til dets avkom mens noen ikke var det, og andre ble likevel gitt videre, men så ut til å kreve miljøfaktorer for å presse avkommet til å uttrykke den gitte egenskapen som lett ble uttrykt i forelder. Mange lignende gjennombrudd skjedde på lignende tidspunkter, overlappende i sin innsikt og beveget seg gradvis frem mot massive endringer i tankene om verdens natur. Denne langsomme, stansende typen fremgang skjer ikke lenger siden ankomsten av moderne transport og kommunikasjon. Mye av den store kaskaden av uavhengige funn ble satt i gang av Darwins avhandling om naturlig utvalg.

I 1859 ga Charles Darwin ut sin revolusjonære bok, "On the Origin of Species." Denne boken stilte en teori om naturlig utvalg, eller "descent with modification", for å forklare hvordan mennesker og alle andre arter kom til å eksistere. Han foreslo at alle artene var avstammet fra en felles stamfar; migrasjons- og miljøkrefter som påvirker visse trekk hos avkom, ga opphav til forskjellige arter over tid. Hans ideer ga opphav til feltet evolusjonsbiologi og er nå universelt akseptert i vitenskapelige og medisinske felt (for mer informasjon om darwinisme, se ressursdelen). Hans vitenskapelige arbeid krevde store intuitive sprang, siden teknologien på den tiden var begrenset, og forskere ennå ikke var klar over hva som skjedde inne i en celle. De visste ennå ikke om genetikk, DNA eller kromosomer. Arbeidene hans ble avledet helt fra det han kunne observere på feltet; med andre ord fenotypene på finkene, skilpadder og andre arter han tilbrakte så mye tid med i deres naturlige leveområder.

Konkurrerende teorier om arv

Samtidig som Darwin delte sine ideer om evolusjon med verden, var en uklar munk i Sentral-Europa ved navn Gregor Mendel en av mange forskere som arbeidet i uklarhet over hele kloden for å bestemme nøyaktig hvordan arvelighet fungerte. En del av hans og andres interesse stammet fra menneskehetens voksende kunnskapsbase og forbedring av teknologi - for eksempel mikroskop - og en del stammet fra et ønske om å forbedre selektiv avl av husdyr og planter. Utenom de mange hypoteser som ble fremsatt for å forklare arvelighet, var Mendels den mest nøyaktige. Han publiserte funnene sine i 1866, kort tid etter publiseringen av "On the Origin of Species", men han fikk ikke utbredt anerkjennelse for sine gjennombruddstanker før i 1900. Mendel døde godt før det, i 1884, etter å ha tilbrakt den siste delen av livet fokuserte på hans plikter som abbed i klosteret i stedet for vitenskapelig forskning. Mendel regnes som far til genetikk.

Mendel brukte primært erteplanter i sin forskning for å studere arvelighet, men funnene hans om mekanismene for hvordan egenskaper blir gitt videre er blitt generalisert til store deler av livet på jorden. I likhet med Darwin jobbet Mendel kun bevisst med fenotypen til erteplantene sine og ikke genotypene deres, selv om han ikke hadde betingelsene for noen av konseptene; det vil si at han bare var i stand til å studere deres synlige og håndgripelige egenskaper, fordi han manglet teknologien for å observere cellene og DNA-en deres, og visste faktisk ikke at DNA eksisterte. Ved å bruke kun sin bevissthet om erteplantenes grove morfologi, observerte Mendel at det var syv trekk i alle plantene som manifesterte seg som en av bare to mulige former. For eksempel var en av de syv egenskapene blomsterfarge, og erteplantenes blomsterfarge vil alltid være enten hvit eller lilla. En annen av de syv trekkene var frøform, som alltid ville være enten rund eller rynket.

Tidens overveiende tankegang var at arvelighet innebar blanding av egenskaper mellom foreldre når de ble gitt videre til avkom. I følge blandingsteorien, hvis en veldig stor løve og en liten løvinne parret, kan deres avkom være mellomstore. En annen teori om arvelighet ble posert av Darwin som han kalte “pangenese.” I følge pangeneseteorien ble visse partikler i kroppen endret - eller ikke endret - av miljøfaktorer i løpet av livet, og deretter passerte disse partiklene gjennom blodstrømmen til kroppens reproduksjonsceller, hvor de kunne overføres til avkom under seksuell reproduksjon. Selv om Darwins teori var mer spesifikk i sin beskrivelse av partikler og blodoverføring, lik teoriene til Jean-Baptiste Lamarck, som feilaktig trodde at egenskaper som ble tilegnet i løpet av livet, ble arvet av ens avkom. F.eks. Postulerte evolusjonen i Lamarckian at giraffens nakker vokste gradvis lenger for hver generasjon fordi giraffer strakk nakken for å nå bladene, og deres avkom ble født med lengre hals som resultat.

Mendels Intuisjon om genotype

Mendel bemerket at erteplantenes syv trekk alltid var en av de to formene, og aldri noe i mellom. Mendel avlet to erteplanter med for eksempel hvite blomster på den ene og lilla blomster på den andre. Deres avkom hadde alle lilla blomster. Han var interessert i å oppdage at når den purpurblomstrete avkomgenerasjonen ble krysset med seg selv, var den neste generasjonen 75 prosent lillablomstret og 25 prosent hvitblomstret. De hvite blomstene hadde på en måte ligget sovende gjennom den helt lilla generasjonen, for å dukke opp igjen. Disse funnene motbeviste effektivt blandingsteorien, så vel som Darwins pangenese-teori og Lamarcks teori om arv, siden alle disse krever at det oppstår gradvis skiftende egenskaper hos avkom. Selv uten å forstå kromosomers natur, introduserte Mendel eksistensen av en genotype.

Han teoretiserte at det var to “faktorer” som opererte for hver egenskap innen ertplantene, og at noen var dominerende og noen recessive. Dominans var det som fikk de lilla blomstene til å ta over den første generasjonen avkom, og 75 prosent av den neste generasjonen. Han utviklet prinsippet om segregering, der hvert allel i et kromosompar skilles ut under seksuell reproduksjon, og bare ett overføres av hver av foreldrene. For det andre utviklet han prinsippet om uavhengig utvalg, der allelen som overføres velges ved en tilfeldighet. På denne måten utviklet Mendel bare sin observasjon og manipulering av fenotype, den mest omfattende forståelsen av genotype som ennå er kjent for menneskeheten, mer enn fire tiår før det til og med var et ord for begge begrepene.

Moderne fremskritt

På begynnelsen av 1900-tallet utviklet forskjellige forskere, som bygger på Darwin, Mendel og andre, en forståelse og ordforråd for kromosomer og deres rolle i arven etter trekk. Dette var det siste store skrittet i det vitenskapelige samfunns konkrete forståelse av genotype og fenotype, og i 1909 brukte biologen Wilhelm Johanssen disse begrepene for å beskrive instruksjonene som er kodet i kromosomer, og de fysiske og atferdsmessige trekkene manifesterte seg utad. I det halvannet århundre forbedret mikroskopets forstørrelse og oppløsning drastisk. I tillegg ble vitenskapen om arvelighet og genetikk forbedret med nye typer teknologi for å se inn i små rom uten å forstyrre dem, for eksempel røntgenkrystallografi.

Teorier om mutasjoner som formet evolusjonen av arter ble fremstilt, så vel som om forskjellige krefter som påvirket retningen til naturlig seleksjon, for eksempel seksuell preferanse eller ekstreme miljøforhold. I 1953 presenterte James Watson og Francis Crick, som bygger på arbeidet med Rosalind Franklin, en modell for en dobbel helixstruktur av DNA som vant de to mennene Nobelprisen og åpnet for et helt fagfelt. I likhet med forskere for mer enn et århundre siden, begynner dagens forskere ofte med fenotype og foretar slutninger om genotype før de utforsker videre. I motsetning til forskere fra 1800-tallet, kan imidlertid moderne forskere nå komme med spådommer om individenes genotyper basert på fenotyper og deretter bruke teknologi for å analysere genotypene.

Noe av denne forskningen er medisinsk karakter, fokusert på mennesker med arvelig sykdom. Det er mange sykdommer som kjører i familier, og forskningsstudier vil ofte bruke spytt eller blodprøver for å finne den delen av genotypen som er relevant for sykdommen for å finne det defekte genet. Noen ganger er håpet tidlig intervensjon eller kur, og noen ganger vil det å kjenne tidligere forhindre plagede individer fra å overføre genene til avkom. For eksempel var denne typen forskning ansvarlig for oppdagelsen av BRCA1-genet. Kvinner med mutasjoner av dette genet har en veldig høy risiko for å utvikle bryst- og eggstokkreft, og alle mennesker med mutasjonen har høyere risiko for andre kreftformer. Fordi det er en del av genotypen, vil et familietre med den muterte BRCA1-genotypen sannsynligvis ha en fenotype av mange kvinner plaget med kreft, og når individer blir testet, vil genotypen bli oppdaget og forebyggende strategier kan diskuteres.